RM 8375(美国NIST)微生物基因组DNA标准品RM 8375
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RM 8375(美国NIST)微生物基因组DNA标准品(MG-001, MG-002, MG-003, MG-004)
RM 8375 - Microbial Genomic DNA Standards for Sequencing Performance Assessment(MG-001, MG-002, MG-003, MG-004)
该参考材料(RM)用于微生物全基因组测序的验证,优化,过程评估和性能评估。特别注意评估基因组序列。 RM 8375的单位由四个小瓶组成。每个小瓶含有不同的微生物基因组DNA样品(MG-001 Salmonella Typhimurium LT2,MG-002 Staphylococcus aureus,MG-003 Pseudomonas aeruginosa和MG-004 Clostridium sporogenes)。 该材料旨在帮助评估高通量微生物DNA测序方法的性能。该基因组DNA已从细胞培养物中提取。因为RM是提取DNA,所以它不会评估DNA提取等预分析步骤。然而,它确实挑战了测序文库制备,测序机,碱基调用算法以及随后的生物信息学分析。该RM不用于评估其他生物信息学步骤,如菌株鉴定,系统发育分析或基因组注释。评估基因组DNA的纯度适合于这些目的。