RM 8391(美国NIST)人类DNA标准物质RM 8391

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RM 8391 - 用于全基因组变异评估的人类DNA(东欧德系犹太祖先的儿子)

RM 8391 - Human DNA for Whole-Genome Variant Assessment (Son of Eastern European Ashkenazim Jewish Ancestry)

此参考材料(RM)旨在用于验证,优化和过程评估目的。它由东欧德系犹太血统的雄性全人类基因组样本组成,可用于评估基因组测序变异调用的表现。 RM 8391的单位由含有人基因组DNA的小瓶组成,所述人基因组DNA从Coriell Institute for Medical Research(Camden,NJ)的单个大生长的人类淋巴母细胞系GM24385中提取。小瓶含有约10μg基因组DNA,标称长度分布的峰长于48.5kb,如Lambda DNA所示,并且DNA在TE缓冲液(10mM TRIS,1mM EDTA,pH8.0)中。 该材料旨在通过获得真阳性,假阳性,真阴性和假阴性的估计来评估人类基因组测序变体调用的性能。测序应用可包括全基因组测序,全外显子组测序和更有针对性的测序,如基因组。该基因组DNA的分析方法与实验室处理和分析提取的DNA的任何其他样本相同。因为RM是提取DNA,所以它对于评估DNA提取等预分析步骤没有用,但它确实挑战了测序文库制备,测序机器以及映射,比对和变体调用的生物信息学步骤。该RM不用于评估随后的生物信息学步骤,例如功能或临床解释。

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