RM8392(美国NIST)人类DNA标准参考物质RM8392

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RM 8392 - 用于全基因组变异评估的人类DNA(东欧德系犹太祖先三重奏)

RM8392 - Human DNA for Whole-Genome Variant Assessment (Trio of Eastern European Ashkenazim Jewish Ancestry)

此参考材料(RM)旨在用于验证,优化和过程评估目的。它包含来自东欧德系犹太血统的儿子 - 父亲 - 母亲三人组的三个完整的人类基因组样本,并且它可用于评估基因组测序中变体调用的表现。 RM 8392的单位由三个小瓶组成,其中含有来自特定家庭成员(儿子,父亲,母亲)的人类基因组DNA;从Coriell医学研究所(Camden,NJ)分别从人类淋巴母细胞样细胞系(GM24385,GM24149和GM24143)的三个大生长中提取。每个小瓶含有约10μg的基因组DNA;标称长度分布的峰值长于48.5 kb,如Lambda DNA所示;在TE缓冲液(10mM TRIS,1mM EDTA,pH8.0)中。

该材料旨在通过获得真阳性,假阳性,真阴性和假阴性的估计来评估人类基因组测序变体调用的性能。测序应用可包括全基因组测序,全外显子组测序和更有针对性的测序,如基因组。该基因组DNA的分析方法与实验室处理和分析提取的DNA的任何其他样本相同。因为RM是提取DNA,所以它对于评估DNA提取等预分析步骤没有用,但它确实挑战了测序文库制备,测序机器以及映射,比对和变体调用的生物信息学步骤。该RM不用于评估随后的生物信息学步骤,例如功能或临床解释。

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